对于王恭厂大爆炸，解释不一。
地震出版社图书《王恭厂大爆炸》第一部分“王恭厂灾史料辑录”的“灾前后异常现象”摘录很多谈什么灾前多处火神庙火球滚出、火神像自己移动。这种迷信说法不科学。
现代学者们的新论多。有人认为是地震引起的，有人说是火药自爆、也有人认为陨星坠落，认为隐火山热核强爆有之，认为是由地震、火药及可燃气体静电爆炸同时作用亦有之，更有甚者，认为是外星人入侵、UFO降临等。但每一个观点都没有摆出无可辩驳的证据，使人完全信服。有以下四种说法：
北京地区历来地震频繁，仅明代就大小震百余起。天启六年五月初六灾变虽官方未明确为地震，但灾变前后种种迹象与地震前后现象有许多相符之处。且史书文献中与地震有关的记载也很多，如：“大震一声”、“余震”、“震撼天地”、“时息地震”、“震后”故可推断，这场王恭厂灾变，是因地震直接促发火药库而引起的。若此推断成立，那么这次地震具有裂度大而震区面小的特点，比如震灾中心（宣武门内大街以西，刑部街以南）破坏力几乎达到摧毁性程度；然而在离震灾中心较近的建筑真如寺、承恩寺等均未受到多大破坏，这种情况是举世未见的；再者蘑菇状烟云，也不是地震出现的现象；又如“不论男女，尽皆裸体”，“寸丝不挂”，“褫衣物”的现象，也非地震的后果；至于灾变中产生的巨大冲击波，在地震史上恐怕也少有先例。
宇宙中星体冲入地球大气层时，其前方空气受到强压而温度陡然上升到几千度甚至万度，使流星——陨石表面物质熔化和气化，并与大气分子撞击而发光，形成火花、火球。当火花、火球消失后，人们可能听到霹雳声、雷鸣声、爆炸声。陨石落地，形成陨石坑。当陨石与地面撞击时，会发出震动与响声，这就如同文献记载那样：“有声如吼”，“但见飙光一道，内有大光”，“忽大震一声，裂逾急霆”，“深坑数丈”，“烟云直上”，“巨石空中飞注如雨”，“烟尘障空，白昼晦冥”，“西安门一带皆霏落铁渣，如麸如米”等等现象，完全与之吻合。陨落也完全有可能使房屋“猝然倾倒”，“大树尽拔出土”，以及“大木飞至密云”，灾区数里“尽为齑粉”。但陨落说，也难以解释灾变前后的种种地震征兆。
事件介绍
1922年，印度考古学家巴那耳季，在印度河的一个小岛屿上发现了一片古代废墟。从遗迹上看，这里原来是座城市，好像在3500年前的某一天突然毁灭了。这里究竟发生了什么事?多年来人们对此一直迷惑不解，所以就给这座城市起了一个奇怪的名字：摩亨佐达罗，意思是“死丘”。
这座城市是怎么毁灭的?科学家经过了大量的实地考察，提出了洪灾、瘟疫和外族入侵几种可能。另外，英国科学家杰汶波尔和意大利科学家温琴季还提出一个惊人的假说：摩亨佐达罗城遭受了核弹袭击！
他们认为，虽然城市建在一条有充足水源的河流岛上，却没有发现任何洪水灾害的痕迹。相反，种种迹象却表明这里曾经发生过一场大规模的火灾。
在摩亨佐达罗城还发现了不少爆炸的痕迹，他们找到了一个爆炸中心，中心地区的建筑物都夷为了平地。由这个中心向外，距离越远的地方毁坏程度就越小，而在最边缘的地区建筑物几乎完好无损。这和原子弹爆炸后的景象十分相似。
另外，在印度古代梵语叙事诗《摩呵婆罗多》中有一段关于战争的描写：“好像自然的威力一下子迸发了出来。太阳在旋转。武器的热焰使得大地熊熊燃烧。大象被火烧得狂奔，想躲避这可怕的灾难。河水沸腾，百兽死去，敌人一片片倒下，尸体狼藉。马和战车都被烧毁了，整个战场一片大火劫后的景象。海面上死一般的沉寂，起风了，大地亮了起来。这真是一幅令人毛骨悚然的画面，死者的尸体被可怕的大火烧得肢体不全，不复成形。我们从来没有见到过或听说过这样一种武器。”这可怕的场面使很多人把这种武器同核弹联系在一起。一些人甚至认为，摩亨佐达罗是被外星人摧毁的。
死丘五千年古城
和现代城市结构极其相似
曾是一片繁华肥沃的土地
遗址北侧的博物馆内陈列着考古发掘。出土的石头砝码、金银、玛瑙等勾勒出当时的社会状况。土陶上的红色图案，印章上的牛、象和鳄鱼等图案及各种泥塑陶俑，如一部原始纪录片，传递出先民的生活状态。所有文物中，青铜舞女和石雕男子最具代表性。舞女佩戴着夸张的项链和手链，叉腰翘首，睥睨四方。石雕男子面蓄胡须，左肩斜搭绣花长袍，表情平静得令人难以琢磨。两个人物一动一静，形成强烈反差。
博物馆有幅描述当年城市的图画。尽管有些夸张，却反映出当时社会的繁华：城内人头攒动，城外土窑冒着青烟，印度河上舟楫穿梭。若把想像扩展一下，画上还应有城外的大片耕地，种植着大麦、棉花和豆类等。而如今这片土地盐碱化严重，到处生长着名叫柽柳的灌木。
千年古文明突然衰落
莫亨乔达罗的文明持续了千余年，公元前1750年前后突然衰落。那段时期，印度河泛滥，农业收成锐减，人们四散逃荒，古城逐渐被遗弃。也有人认为是人为破坏，因为《俱利吠陀》一书提到，雅利安人从欧洲进入南亚时与印度河附近的土著居民发生冲突，战争和杀戮导致这座古城消亡。
1945年8月，第二次世界大战后期，美国在日本广岛投下了震惊世界的第一颗原子弹。这颗在距离地面1800英尺上空爆炸的原子弹，给广岛人民带来了巨大的灾难。然而，广岛原子弹的破坏景象却意外地给研究“通古斯大爆炸”的科学家们以新的启示。那雷鸣般的爆炸声、冲天的火柱、蘑菇状的烟云，还有剧烈的地震、强大的冲击波和光辐射，这一系列的现象与通古斯大爆炸简直相似到了惟妙惟肖的地步。于是，前苏联的军事工程专家卡萨茨夫第一次大胆地提出了1908年通古斯大爆炸是一场热核爆炸的新见解。
1946年，提出“热核爆炸说”的卡萨茨夫不仅肯定了“通古斯大爆炸”是一场核爆炸，更惊人的是，不久后他还第一次提出了这样一个大胆推测：通古斯大爆炸的神秘怪物是第一艘访问我们地球的太空飞船。
1965年，三位美国科学家提出，通古斯大爆炸事件可能是从太空降到地球来的一种反物质———反陨石造成的。他们在调查报告中说，当天，一个由“反物质”组成的陨石意外地闯入了地球并导致了这场灾难。他们认为：半克“反铁”与半克铁相撞，就足以产生威力大于在广岛爆炸的那颗原子弹的破坏力。
第一位提出“彗星撞击说”的，是前苏联科学院院士彼得洛夫。他认为引起通古斯爆炸的，是一个来自太阳系遥远地方的由稀松的雪团组成的彗星。当它以每小时4万公里的速度冲破地球表面的大气层时，由于摩擦产生了过热的气体。这种气体一接触地面，就发生了相当于数颗原子弹破坏力的巨大冲击波，由于彗星很快便蒸发完了，所以地球上没有留下任何残骸作为“物证”。
正如在6500万年前，昌盛一时的爬行类动物恐龙神秘地从地球上消失了一样，“第一代人类文明”也是因为某种原因，从地球上神秘地消失了。当然，这种假设还有待于科学家作进一步的考证。如果这种假设成立，那么毁灭”第一代人类文明”的元凶又是什么呢？
发生在本世纪初，位于西伯利亚的一场神秘的大爆炸，就为寻求答案的科学家们，提供了一个线索。
由于通古斯地区地处偏远，大爆炸发生的最初十几年中，一直无人问津。直到1927年，前苏联的地质学家库利克才带队亲临现场考察。一望无际的被烧焦的树木，使考察队员得出结论：大火是在大范围内辐时燃烧起来的。部分考察队员推测，大火是由火山喷发引起的。但爆炸区内，并没有找到火山口，显然，这种推测是错误的。库利克决心弄清大爆炸的真实原因，他访问了许多火球从天而降的目击者，并先后4次进入通古斯地区，进行了详尽的实地考察，最后，他得出结论：是一颗庞大的陨石在在快速运动中，与大气摩擦后，充分燃烧分解，引起大爆炸。但是，如果真是这种情况，就一定能在该地区找到陨石碎片，遗憾的是，库利克和众多考察队员，费尽了周折，也没有找到任何陨石碎片。
通古斯引起了前苏联科学家的足够重视，许多一流的科学家每年夏天都要去通古斯考察，他们搜集了大量的资料。
其中有个叫法斯特的科学家，测出了大爆炸所摧毁的树木占地约850平方英里。在这之后，又经过35年的艰苦努力，法斯特拼出了该区域内被毁树木的详解图。根据此图，科学家们推算出，这片原始森林，当年是被一个自西向东飞行的，相当于1～2千万TNT当量的天体，在距地面4英里的高空爆炸所毁。就此，大爆炸的真实原因逐渐露出端倪。
随着苏联的解体，冷战结束。大批西方科学家蜂拥而至，他们对通古斯的兴趣是显而易见的，搞清大爆炸的真实原因，对人类本身有着至关重要的意义。暂且不说“第一代人类文明”是还存在，又是如何毁灭的，仅是搞清6500万年前，恐龙神秘消失的原因，对科学家们来说，就是个不小的进步。