9月28日维多利亚港内出现水龙卷（图一），这是自1959年起首次在维多利亚港内有水龙卷报告。而根据记录，以往观测到的水龙卷大多发生在本港东部水域、南部水域如长洲、南丫岛附近以及大屿山一带。受高空扰动影响，香港在9月28日天气不稳定，早上虽然有阳光，但温度上升令大气的不稳定度增加，有利强对流天气发展。天文台于上午11时05分发出雷暴警告，初时雷雨较集中在新界北部，随著雷雨区发展，港岛东及九龙东亦逐渐受影响。维港当日初时吹西风，而一股偏东气流在日间由东向西逐渐影响香港，维港东部随之出现偏东风（图二），造成了局部地区的水平风切变。两股气流相遇之处容易有漩涡形成，最后维港短暂出现了水龙卷。
图一 9月28日（星期六）在维港出现的水龙卷
图二 9月28日下午12时25分维港一带的风场
水龙卷属小尺度的强对流天气系统，发展迅速，强度及移动变化较大。其出现时间、位置有非常大的随机性，生命周期可以非常短，由形成到消散可能历时只有数分钟至十数分钟，所以即使以现今最先进科技也较难提早对其作出准确预测。
当发生雷暴及强对流天气时，天文台会综合分析不同的观测数据，包括本地以至邻近地区的气象资料，透过雷达分析强对流的发展和移动，适时发出雷暴警告及特别天气提示。不过由于本港有不少高山，为了监测仍在较远位置但可能影响本港的天气系统（如热带气旋、飑线等），天气雷达一般安装在较高的山上，因此它们对监测近地面或海面且尺度细小的天气系统仍有限制。另一方面，初步分析显示天文台现时在沙螺湾运行的相控阵天气雷达可捕捉到该系统，但由于受其附近的地形阻挡，仍未能清楚监测到维港近海面的情况。天文台计划通过建立相控阵雷达网络，以加强监测这类尺度细小的强对流天气系统。
当雷暴及强对流天气出现时，天文台会按情况在雷暴警告中提及「强烈狂风雷暴」及相关的高影响天气资讯，包括猛烈阵风、冰雹、水龙卷或龙卷风等。这些天气现象均可以造成破坏，破坏力视乎其强度。当强烈的龙卷风经过时，单薄的建筑物可能会抵受不住强大风力及室内室外的气压差而损毁，树木及汽车等会被吹起，在海上亦曾经有小型船只遇到水龙卷而沉没。在香港，龙卷风及登陆后的水龙卷都曾对建筑物造成破坏，但这种情况较为罕见。市民在遇到这些强对流天气时，应采取雷暴警告中的预防措施，包括：
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水龙卷是一条快速旋转、夹杂著水滴的云柱，由对流云的底部连接著水面。水龙卷的风速一般较陆地上的龙卷风为低。由于水龙卷有时能将水吸起，它也俗称为「龙吸水」。
水龙卷可分为两大类型（图三）：
第一类较为常见的水龙卷，是在相对良好的天气下发生，和雷暴没有直接关系。漩涡先在海面上开始发展，然后逐渐向上伸展，当漏斗形成时，水龙卷已达成熟阶段。这类水龙卷的生命周期和移动路径都较短，一般不会持续超过二十分钟。此外，当它们登上陆地后，便迅速消散，很少会深入内陆。
第二类水龙卷的形成机制和特征则与陆上的龙卷风相同，通常和强雷暴相关。它们会伴随著恶劣天气如大风及冰雹，并有时会在陆上发展之后移至海上。与第一类不同，这类水龙卷在雷暴内由上至下发展，在起初阶段会先出现漏斗云，之后逐渐延伸至地面或海面。
图三 水龙卷的两大类型
翻查天文台记录，过去二十年平均每年收到约一次龙卷风或水龙卷报告，而较常收到水龙卷或龙卷风报告的月份是5月至10月。至于收到较多水龙卷报告的年份是2003年、2005年及2018年，这三年都分别收到4次水龙卷报告。